SNS-99
En permanent karteringspopulation för grans genomik er bevilget
SAMMANFATTNING:
Knoppsättning hos gran är en egenskap av stor ekonomisk betydelse. Knoppsättning bestäms huvudsakligen av fotoperiod och uppvisar en stark latitudinell gradient tillsammans med hög arvbarhet. Detta tyder på att lokal anpassning påverkar knoppsättningen. För att undersöka genetiska mekanismer som styr knoppsättning kommer vi att använda en kombination av tillgängliga metoder inom funktionell genomik, kvantitativ genetik och populationsgenetik med målet att identifiera genetiska markörer som är kopplade till knoppsättning. Dessa markörer kan sedan användas i förädlingsarbete genom att välja träd med en viss genetisk markör (Marker Assisted Selection (MAS)). För att hitta dessa markörer undersöker vi genetisk variation hos naturliga populationer för ett antal kandidatgener för knoppsättning tillsammans med neutrala markörer som inte har någon koppling till knoppsättning. Den genetiska variationen undersöks i en karteringspopulation bestående av 14 populationer (varje population består av 30 öppet pollinerade familjer med 25 fröplantor från varje familj). Fenologiska data från dessa populationer har samlats under de senaste två åren. Dessa tidigare studier av populationerna har varit del av ett EU-finansierat projekt, TREESNIPS. Målet med det föreslagna projektet är att bevara denna unika resurs och skapa en permanent karteringspopulation för genomisk forskning och förädlingsarbete i gran, Picea abies. För närvarande används karteringspopulationen för att studera knoppsättning men andra viktiga egenskaper inom förädling tex träkvalite kan med fördel studeras i denna population. Eftersom genomiska studier är både kostsamma och tidskrävande skulle det vara en stor fördel att koncentrera insatser på en permanent karteringspopulation för att göra snabbare framsteg.